No existen actualmente en el Ayuntamiento Juntas Municipales de Distrito (descentralización funcional).
Entes instrumentales que conforman el sector público municipal son los siguientes:
- Sociedades de capital íntegramente municipal:
- Empresa Municipal de Transporte Urbano de viajeros (EMTUSA).
- Empresa Municipal de Limpieza de Colegios y Dependencias Municipales S.A (EMLICODEMSA)
- Empresa Municipal Huelva Digital, TDTL S.A
- Empresa Municipal Huelva Deporte SL
- Sociedad de capital mixto; Empresa Municipal de Aguas de Huelva S.A (51% del accionariado perteneciente al Ayuntamiento y 49% de la mercantil HIDRALIA, S.A)
- Fundación del Festival de Cine Iberoamericano de Huelva, de la que son Patrones el Ayuntamiento de Huelva, la Diputación Provincial, la Junta de Andalucía (Consejería de Cultura y Patrimonio) y la Administración del Estado (Ministerio de Cultura).
No existen en el Ayuntamiento Entidades Públicas empresaariales ni organismos autónomos .
Las webs de dichos organismos son los siguientes:
- EMPRESA MUNICIPAL HUELVA DIGITAL TDTL S.A :http://www.huelvatv.com
- EMTUSA: http://www.emtusahuelva.es/
- EMPRESA MUNICIPAL DE AGUAS DE HUELVAS.A: http://aguashuelva.com
- EMLICODEMSA: https://emlicodemsa.es/
- FUNDACIÓN DEL FESTIVAL DE CINE IBEROAMERICANO DE HUELVA: https://festicinehuelva.com/